Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chpf2Q3UU43 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chpf2Q3UU43 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chpf2Q3UU43 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms