Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm28047Q3US59 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm28047Q3US59 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms