Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Znf48Q3US17 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Znf48Q3US17 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf48Q3US17 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf48Q3US17 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf48Q3US17 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf48Q3US17 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Znf48Q3US17 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf48Q3US17 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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