Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc190Q3URK1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms