Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SbsponQ3UPR9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SbsponQ3UPR9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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