Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc1Q3UPH1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc1Q3UPH1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms