Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN02

Lclat1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lclat1Q3UN02 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lclat1Q3UN02 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lclat1Q3UN02 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lclat1Q3UN02 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lclat1Q3UN02 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lclat1Q3UN02 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms