Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hdgfl2Q3UMU9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms