Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cog7Q3UM29 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cog7Q3UM29 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms