Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Spg7Q3ULF4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spg7Q3ULF4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spg7Q3ULF4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms