Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CrxosQ3UL53 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CrxosQ3UL53 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms