Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcgf5Q3UK78 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pcgf5Q3UK78 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pcgf5Q3UK78 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms