Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf44Q3UHJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf44Q3UHJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms