Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Arfgef3Q3UGY8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arfgef3Q3UGY8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms