Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft2Q3UF64 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft2Q3UF64 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms