Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q3U6N9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q3U6N9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms