Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gse1Q3U3C9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gse1Q3U3C9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gse1Q3U3C9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms