Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pag1Q3U1F9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pag1Q3U1F9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms