Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trmt1Q3TX08 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trmt1Q3TX08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms