Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccndbp1Q3TVC7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccndbp1Q3TVC7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms