Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Calr4Q3TQS0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calr4Q3TQS0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calr4Q3TQS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms