Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prrc2cQ3TLH4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms