Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem248Q3TBN1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem248Q3TBN1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms