Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hddc2Q3SXD3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hddc2Q3SXD3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms