Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm1Q2TV84 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Trpm1Q2TV84 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trpm1Q2TV84 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms