Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smrp1Q2MH31 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smrp1Q2MH31 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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