Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrp1aQ2LKU9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms