Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Shroom4Q1W617 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Shroom4Q1W617 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Shroom4Q1W617 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
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