Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Samd11Q1RNF8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Samd11Q1RNF8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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