Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Fam171bQ14CH0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms