Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rpusd3Q14AI6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rpusd3Q14AI6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rpusd3Q14AI6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rpusd3Q14AI6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rpusd3Q14AI6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpusd3Q14AI6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpusd3Q14AI6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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