Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prok1Q14A28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prok1Q14A28 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms