Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli2Q0VGT2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gli2Q0VGT2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gli2Q0VGT2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms