Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ttc39dQ0VF76 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ttc39dQ0VF76 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ttc39dQ0VF76 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ttc39dQ0VF76 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ttc39dQ0VF76 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ttc39dQ0VF76 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ttc39dQ0VF76 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ttc39dQ0VF76 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ttc39dQ0VF76 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms