Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Samd12Q0VE29 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd12Q0VE29 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms