Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rundc1Q0VDN7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rundc1Q0VDN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms