Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Neurl1bQ0MW30 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Neurl1bQ0MW30 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms