Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubxn2bQ0KL01 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2bQ0KL01 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms