Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttc21bQ0HA38 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ttc21bQ0HA38 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttc21bQ0HA38 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms