Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc4Q08624 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms