Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MestQ07646 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MestQ07646 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MestQ07646 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MestQ07646 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MestQ07646 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MestQ07646 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MestQ07646 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms