Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
NrepQ07475 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NrepQ07475 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
NrepQ07475 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms