Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nfe2Q07279 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nfe2Q07279 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nfe2Q07279 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms