Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CluQ06890 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CluQ06890 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CluQ06890 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CluQ06890 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CluQ06890 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CluQ06890 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CluQ06890 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CluQ06890 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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