Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atf4Q06507 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atf4Q06507 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms