Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrx2Q06348 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrx2Q06348 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms