Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPINDOCQ05AH6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPINDOCQ05AH6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms