Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a1Q05722 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Col9a1Q05722 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Col9a1Q05722 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms