Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdk18Q04899 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms