Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RelbQ04863 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelbQ04863 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RelbQ04863 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms